El 17 de diciembre de 1981 se eleva al Obispado de Lomas de Zamora la inquietud nacida, desde hacía algún tiempo entre los integrantes de la comunidad cristiana, sobre la necesidad de crear una escuela en sus niveles Inicial y Primario. El pedido se apoyaba en la gran cantidad de niños en edad escolar que habitaban dentro del perímetro de la parroquia y que asistían a un jardín de infantes que funcionaba en un club de barrio ubicado a una cuadra del actual colegio. Las familias deseaban que sus hijos se educaran dentro del marco de la vida cristiana. El 20 de diciembre de 1981 el párroco de esta comunidad recibía la aprobación del Obispado. 

El 1º de marzo de 1982 se funda la escuela “Gruta Nuestra Señora de Lourdes”, que funcionaba en un espacio parroquial. De a poco, va creciendo la cantidad de alumnos y grados, y se adquieren terrenos linderos para ampliar las instalaciones. Es en el año 1990 cuando el Jardín de Infantes, que estaba integrado a la Escuela Primaria, se independiza.

El 24 de abril de 2001 el Papa Juan Pablo II une al partido de Lanús a la diócesis de Avellaneda, creando la diócesis de Avellaneda- Lanús. En el año 2002, el Instituto Secundario Beato Adolfo Kolping se incorpora a la Institución. De esta manera, comienzan a funcionar en La Gruta los tres niveles de educación: inicial, primario y secundario.